Technicien en Bio informatique pour l'Analyse de Données Multi Omiques
À propos de la mission. Un institut de recherche a développé et continue de faire progresser un ensemble de technologies multi-omiques ciblées et non ciblées, y compris l'omique spatiale, unicellulaire, mononucléaire et perturbationnelle. Ces technologies transforment la vitesse, l'échelle et la résolution avec lesquelles les voies des cellules immunitaires in vivo peuvent être démêlées.
En combinant ces approches avec l'ATAC-seq mononucléaire et les données spatiales, l'objectif est de parvenir à une compréhension complète des mécanismes régulateurs qui façonnent les états des cellules hépatiques en santé et en maladie, y compris le métabolisme, le cancer, la régénération et le développement.
Ce que vous ferez.
- Appliquer des approches computationnelles innovantes pour analyser un large éventail de jeux de données unicellulaires et mononucléaires, y compris l'ARN-seq, l'ATAC-seq et l'omique perturbationnelle.
- Travailler avec des données de transcriptomique spatiale, en utilisant des technologies telles que MERFISH/MERSCOPE, Visium HD et ATERA.
- Vous pourrez choisir de vous concentrer davantage sur l'analyse de données unicellulaires et perturbationnelles ou sur l'analyse de données spatiales, tout en étant exposé à un éventail plus large de technologies.
- Développer, adapter et affiner des pipelines computationnels, souvent en s'appuyant sur des approches développées au sein du laboratoire ou de l'institut.
- Travailler en étroite collaboration avec des collègues computationnels et expérimentaux pour analyser les données de manière détaillée et scientifiquement solide.
- Intégrer et comparer les résultats entre différents types de données et projets, et découvrir des modèles et des informations biologiques.
- Une forte collaboration et communication entre les côtés computationnel et expérimental du laboratoire sera une partie importante du rôle.
Ce qui est demandé
- Diplôme de Bachelor ou de Master en bio-informatique, biomédecine, bio-ingénierie, biotechnologie ou un domaine connexe.
- Maîtrise de l'anglais écrit et parlé.
- Expérience en Python et/ou R.
- Expérience avec Linux et Bash.
- Expérience avec les données de séquençage d'ARN en vrac, unicellulaires ou mononucléaires.
- Capacité à dépanner et à résoudre les problèmes d'analyse de données.
- Expérience de la présentation de résultats computationnels à des collègues de différents horizons scientifiques.
Souhaitable.
- Expérience en analyse de données d'imagerie ou d'omique spatiale.
- Expérience en apprentissage automatique (machine learning).
- Compréhension de base de l'immunologie.
Profil
- Enthousiaste et curieux de la recherche scientifique.
- Aime apprendre de nouvelles techniques computationnelles et souhaite rester à la pointe de la technologie.
- Travaille avec précision et évalue de manière critique ses analyses et leur mise en œuvre.
- Travaille efficacement, est orienté solution et objectif, et est capable de fixer des priorités.
- Flexible et peut bien s'adapter aux changements de priorités.
- Peut bien travailler en équipe et de manière autonome.
- Apprécie les autres cultures et est respectueux des autres et de leurs idées et opinions différentes.
- Un membre d'équipe mature et professionnel qui communique ouvertement et respectueusement, gère les désaccords de manière constructive et contribue à un environnement de travail positif.
Comment postuler
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Plus de contexte, moins d'heures de recherche dispersees.
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