Het immuunsysteem speelt een centrale rol in de bescherming van het lichaam tegen pathogenen en het detecteren en elimineren van abnormale cellen. Lymfeklieren zijn belangrijke organen van het immuunsysteem, cruciaal voor immuuncelactivatie en de initiatie van adaptieve immuunresponsen. Veel cellulaire en moleculaire processen die de functie van lymfeklieren reguleren, zijn echter nog onvoldoende begrepen.
Als postdoc ontwikkel je een mechanistisch, spatio-temporeel multiscale computationeel model van de lymfeklier. Je integreert agent-based modellering met differentiaalvergelijkingen om immuunresponsen beter te begrijpen. Dit is een tweejarige postdoctorale positie. Je draagt bij aan de ontwikkeling van deze onderzoekslijn en gebruikt computationele modellering om fundamentele vragen in de immunologie te beantwoorden.
Wat je doet
- Een initiële model ontwikkelen in de Julia programmeertaal, gericht op T-celactivatie op cellulair en moleculair niveau, inclusief celmotiliteit en cel-celinteracties, genregulerende en signaleringsnetwerken, en chemokinegradiënten.
- Het model uitbreiden met extra lymfekliercompartimenten of -processen, zoals de B-celregio en kiemcentrumdynamiek, of stromale en fibroblastpopulaties.
- Single-cell omics en andere datasets uit openbare repositories en van samenwerkingspartners gebruiken om het model te definiëren en te parameteriseren.
- Zorgen dat het model goed gedocumenteerd en toegankelijk is voor andere onderzoekers door gebruik te maken van een specifiek framework.
- Bijdragen aan onderwijs bij een academisch medisch centrum of een universiteit en een subsidievoorstel schrijven om onderzoeksfinanciering aan te trekken en een eigen onderzoekslijn op te zetten.
Profiel
Je bent een computationeel wetenschapper met een sterke interesse in biologie, immunologie en single-cell omics. Je combineert technische expertise met analytisch denken en heldere communicatie. Je bent een ambitieuze onderzoeker die graag in een interdisciplinaire omgeving werkt en de leiding neemt bij het ontwikkelen van een onderzoeksproject.
Wat ze vragen
- Een PhD in computationele wetenschappen of een gerelateerd vakgebied en ervaring in een eerdere postdoctorale onderzoekspositie.
- Ervaring met agent-based modellering en differentiaalvergelijkingen.
- Sterke programmeervaardigheden in Julia of Python en ervaring met tools zoals Git, Visual Studio Code en CoPilot of Claude Code.
- Sterke communicatie-, presentatie- en wetenschappelijke schrijfvaardigheden, met het vermogen om zelfstandig en in teamverband te werken.
- Een goede beheersing van het Engels, zowel mondeling als schriftelijk.
Wensen
- Kennis of ervaring met R, immunologie en single-cell omics is een voordeel.
Hoe solliciteren?
Bekijk de volledige opdrachttekst en sollicitatie-informatie zodra je sollicitatie op maat klaarstaat.
Bestel een sollicitatie op maat om de volledige opdracht en sollicitatie-informatie te bekijken.
Meer context, minder losse zoekuren.
Je krijgt net genoeg context om te beoordelen of deze opdracht interessant is. De volledige briefing, klantdetails en vervolgstappen blijven beschikbaar in de app.